高锰酸钾去除法：用高锰酸钾加水稀释成深红色溶液，然后把乌龟放进去浸泡两分钟，然后换清水。
干养法：白天正常养殖，晚上换水后不放水，干养一晚，第二天早上再放水喂食，如此重复三天，能去除水霉。日晒法：每天排干水晒太阳30分钟左右。
龟立康杀菌灵：换水后每个龟箱倒入一盖子杀菌灵，连续浸泡到第二次换水即可。
乌龟患了水霉病的治疗方法有以下几种：
A、用食盐250克加小苏打250克混合液泼洒于100厘米x55厘米x45厘米的鱼缸，坚持数次，效果显着。
B、在100千克水中溶解孔雀石绿0.3克或次甲基蓝，浸洗身体10~20分钟，数日后可见菌丝脱落。
C、2%-3%的盐水浸洗，每天一次，每次5-10分钟。
D、百万分之二（2ppm）的高锰酸钾加上1%的盐水混合后将病鱼浸泡20-30分钟。
E、提高水温以抑制水霉的生长。并且可用一盏15瓦的紫外线灯每日照射数小时可有效的抑制和消灭水霉菌。
对于有水霉的乌龟，可以用2%-3%的盐水进行浸洗，每天进行5-10分钟。同时提高水温，每天晚上干养。水霉的传播速度很快，健康的乌龟需要及时与病龟隔离，防止被传染水霉。
在得了水霉病后，乌龟需要进行干养，比如白天正常养殖，晚上干养一晚，第二天早上再放水喂食，如此重复，直到水霉消失。