济宁申请货车通行证的方法如下：
现场办理。申请人需准备机动车行驶证原件和复印件等相关资料，前往交警管理支队办事大厅提交给工作人员审核，审核通过后即可办理。
网上办理。申请人可通过交管12123app进行办理，或关注"山东微警务济宁分站"公众号，点击左下角微警务，选择车辆禁区通行证，根据流程提示操作。
通用卡需要交纳10元卡费，至少充值50元，1000元以下不需身份证，1000元以上则需要出示身份证，但无法退卡。办理一卡通无需交纳手续费和年费，只需交纳一次性卡费10元。
用户若办理退卡业务，可携带卡片到山东一卡通直营网点办理相应退卡手续，卡内剩余金额在100元以内不收取任何手续费用，卡内金额在100元(含100元)以上，需收取10%退卡手续费，卡费不退。