马尼拉T3机场回国流程如下：

1. 到达机场后，前往航空公司柜台办理值机手续，提交护照和机票等相关证件。

2. 完成值机后，前往安检口进行安检，注意携带物品的规定，如液体限制等。

3. 安检后，前往候机区等待登机，注意听取广播和观察电子屏幕上的登机信息。

4. 登机前，需要出示护照和登机牌等证件，完成登机手续。

5. 在飞行途中，需要遵守航空公司的规定和要求，如佩戴口罩等。

6. 到达目的地后，按照机场的流程进行入境手续，如填写入境卡、接受体温检测等。

总之，回国流程需要提前了解相关规定和要求，遵守机场和航空公司的规定，确保顺利完成回国。