一般是在春季3-5月和秋季9-11月,每次大约持续十四;发情期间要注意饮食均衡合理,并且最好给边牧犬穿上生理裤。
边牧狗狗一般7-8个月大的时候就会来第一次月经，这也就是狗狗第一次发情的时间。但根据狗狗的体质不同，有些狗狗的生理期会来的比较慢，通常1岁或者2岁左右时才来第一次月经，狗狗一般一次月经会维持7-14天左右。狗狗生理期的时候，如果出门建议给狗狗穿上生理裤，避免细菌感染造成子宫病变。
发情前期的边境牧羊犬会有外阴充血，阴门肿胀，潮红湿润滑，流混有血液的粘液的症状出现。公犬常会闻味而来，但边境牧羊犬母犬不允许交配。
发情期持续约6—14天。表现有继续肿胀、变软，流出的粘液色变浅，出血减少或停止。边境牧羊犬母犬主动或停止。母边境牧羊犬主动接近公犬，当公犬爬跨时主动下蹋腰部，臀部对向公犬，将尾偏向一侧，阴门开闭，允许交配。发情后2—3天，边境牧羊犬母犬开始排卵，是交配的最佳时期。
在边境牧羊犬发情期间，要注意给狗狗补充足够的营养，可以选择给狗狗添加辅食，比如鸡胸肉、鱼肉、白菜、胡萝卜等食物，煮熟切碎，添加在狗粮中喂养，也可以喂边境牧羊犬吃一些营养膏、钙粉、维生素等。在发情期间，如果不打算让边境牧羊犬配种，最好为它穿上生理裤，防止受孕，也防止细菌侵袭。